Povidonijodin ja povidonijodin välillä on yhtäläisyyksiä ja eroja, jotka molemmat ovat desinfiointiaineita. Tarkkaan ottaen povidonijodi ja jodofori ovat molemmat kompleksoituja jodia, pääasiassa siksi, että kompleksinmuodostajan koostumus on erilainen. Povidoni-jodi on iso nimi, ja povidoni-jodi on yleisimmin käytetty povidoni-jodin lajike. Jodofori muodostuu klooriheksidiinialkoholin ja jodin sekä pinta-aktiivisen aineen kompleksoitumisesta, kun taas povidonijodi muodostuu jodin ja PVP:n kompleksoituessa.
Jodoforin käytettävissä oleva jodipitoisuus on 0,2 prosenttia , kun taas povidonijodin jodipitoisuus on 5 prosenttia -1 prosenttia . Käytetyt esineet ovat erilaisia. Jodofori on ihon desinfiointiaine, kun taas povidonijodi on ihon ja limakalvojen desinfiointiaine. Bakteereja tappava vaikutus on myös erilainen, jodofori on vahvempi kuin povidonijodi. Povidonijodi saa aikaan antibakteerisen vaikutuksensa vapauttamalla jatkuvasti vapaata jodia. Sen vaikutusmekanismi on denaturoida ja tappaa bakteerien proteiinia, ja se on tehokas bakteereja, sieniä ja viruksia vastaan. Sillä on vahva laajakirjoinen bakterisidinen voima, alhainen myrkyllisyys ja lähes ei ärsytä eikä syövytä. Lisäksi povidonijodissa on myös oraaliliuosta, mutta se soveltuu kotieläinten, erityisesti kilpikonnien, desinfiointiin.